Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg9bQ6EBV9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg9bQ6EBV9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg9bQ6EBV9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg9bQ6EBV9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms