Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ltn1Q6A009 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ltn1Q6A009 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltn1Q6A009 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms