Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sbno1Q689Z5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sbno1Q689Z5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sbno1Q689Z5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms