Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Top2bQ64511 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Top2bQ64511 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms