Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprdQ64487 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprdQ64487 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprdQ64487 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprdQ64487 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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PtprdQ64487 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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PtprdQ64487 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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PtprdQ64487 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PtprdQ64487 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PtprdQ64487 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprdQ64487 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PtprdQ64487 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PtprdQ64487 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PtprdQ64487 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PtprdQ64487 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PtprdQ64487 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PtprdQ64487 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprdQ64487 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprdQ64487 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprdQ64487 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprdQ64487 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprdQ64487 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprdQ64487 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprdQ64487 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprdQ64487 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprdQ64487 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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PtprdQ64487 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms