Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps72Q62481 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps72Q62481 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps72Q62481 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms