Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nptx1Q62443 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nptx1Q62443 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms