Protein–RNA interactions for Protein: Q62419

Sh3gl1, Endophilin-A2, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl1Q62419 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3gl1Q62419 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl1Q62419 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3gl1Q62419 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms