Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ss18Q62280 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ss18Q62280 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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