Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SypQ62277 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SypQ62277 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SypQ62277 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SypQ62277 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SypQ62277 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SypQ62277 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SypQ62277 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SypQ62277 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SypQ62277 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SypQ62277 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SypQ62277 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SypQ62277 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SypQ62277 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SypQ62277 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SypQ62277 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SypQ62277 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SypQ62277 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SypQ62277 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SypQ62277 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SypQ62277 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SypQ62277 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SypQ62277 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SypQ62277 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SypQ62277 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SypQ62277 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SypQ62277 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SypQ62277 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SypQ62277 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SypQ62277 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SypQ62277 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SypQ62277 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SypQ62277 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SypQ62277 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SypQ62277 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SypQ62277 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SypQ62277 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SypQ62277 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SypQ62277 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SypQ62277 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SypQ62277 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SypQ62277 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SypQ62277 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SypQ62277 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SypQ62277 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SypQ62277 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SypQ62277 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SypQ62277 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SypQ62277 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SypQ62277 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SypQ62277 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SypQ62277 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SypQ62277 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SypQ62277 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SypQ62277 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SypQ62277 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SypQ62277 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SypQ62277 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SypQ62277 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SypQ62277 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SypQ62277 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SypQ62277 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SypQ62277 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SypQ62277 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SypQ62277 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SypQ62277 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SypQ62277 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SypQ62277 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SypQ62277 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SypQ62277 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SypQ62277 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms