Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Kdm5dQ62240 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Kdm5dQ62240 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
Kdm5dQ62240 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.93
Kdm5dQ62240 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Kdm5dQ62240 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms