Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Tgfb1i1Q62219 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgfb1i1Q62219 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tgfb1i1Q62219 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms