Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssr4Q62186 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr4Q62186 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssr4Q62186 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms