Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx3xQ62167 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx3xQ62167 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx3xQ62167 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms