Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PtprrQ62132 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
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PtprrQ62132 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprrQ62132 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PtprrQ62132 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PtprrQ62132 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PtprrQ62132 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PtprrQ62132 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PtprrQ62132 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PtprrQ62132 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PtprrQ62132 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PtprrQ62132 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprrQ62132 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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