Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkciQ62074 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkciQ62074 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.4 ms