Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LbpQ61805 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LbpQ61805 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LbpQ61805 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LbpQ61805 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbpQ61805 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LbpQ61805 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LbpQ61805 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LbpQ61805 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LbpQ61805 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms