Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itga6Q61739 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itga6Q61739 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms