Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccne1Q61457 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccne1Q61457 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccne1Q61457 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms