Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf12Q61286 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf12Q61286 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms