Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc6Q61143 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc6Q61143 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms