Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf4bQ61136 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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