Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp17laQ61068 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp17laQ61068 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms