Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JrkQ60976 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JrkQ60976 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JrkQ60976 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JrkQ60976 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JrkQ60976 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JrkQ60976 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JrkQ60976 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JrkQ60976 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JrkQ60976 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JrkQ60976 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JrkQ60976 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JrkQ60976 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms