Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf4Q60793 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf4Q60793 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms