Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn11Q60771 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn11Q60771 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn11Q60771 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms