Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mkrn3Q60764 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mkrn3Q60764 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms