Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SkiQ60698 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SkiQ60698 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SkiQ60698 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SkiQ60698 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SkiQ60698 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SkiQ60698 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SkiQ60698 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SkiQ60698 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SkiQ60698 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SkiQ60698 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms