Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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PtprnQ60673 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprnQ60673 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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PtprnQ60673 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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PtprnQ60673 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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PtprnQ60673 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PtprnQ60673 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PtprnQ60673 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PtprnQ60673 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PtprnQ60673 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprnQ60673 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PtprnQ60673 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PtprnQ60673 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PtprnQ60673 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PtprnQ60673 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprnQ60673 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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