Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp20Q5XG71 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp20Q5XG71 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp20Q5XG71 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Utp20Q5XG71 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Utp20Q5XG71 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Utp20Q5XG71 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp20Q5XG71 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp20Q5XG71 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms