Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd5Q5VCS6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tdrd5Q5VCS6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms