Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf1Q5U4C3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf1Q5U4C3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf1Q5U4C3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms