Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdcp1Q5U462 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdcp1Q5U462 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms