Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabl6Q5U3K5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabl6Q5U3K5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms