Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc42Q5SV66 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc42Q5SV66 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms