Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AbrQ5SSL4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AbrQ5SSL4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AbrQ5SSL4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms