Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp18Q5SSI6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Utp18Q5SSI6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms