Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmprss11eQ5S248 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmprss11eQ5S248 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms