Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna2d4Q5RJF7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d4Q5RJF7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms