Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm11487Q5RIS0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm11487Q5RIS0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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