Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scarf1Q5ND28 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scarf1Q5ND28 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms