Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps41Q5KU39 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps41Q5KU39 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms