Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf3Q5HZG4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf3Q5HZG4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf3Q5HZG4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf3Q5HZG4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf3Q5HZG4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf3Q5HZG4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf3Q5HZG4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf3Q5HZG4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf3Q5HZG4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms