Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni3kQ5GIG6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnni3kQ5GIG6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnni3kQ5GIG6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3kQ5GIG6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni3kQ5GIG6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3kQ5GIG6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3kQ5GIG6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3kQ5GIG6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3kQ5GIG6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni3kQ5GIG6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni3kQ5GIG6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni3kQ5GIG6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni3kQ5GIG6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni3kQ5GIG6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni3kQ5GIG6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms