Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrc3Q5DU56 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms