Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam208bQ5DTT3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam208bQ5DTT3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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