Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Eme2Q56A04 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Eme2Q56A04 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms