Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm1Q52KI8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm1Q52KI8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms