Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccnl1Q52KE7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccnl1Q52KE7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms