Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1qtnf9Q4ZJN1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1qtnf9Q4ZJN1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms